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一个旨在帮助全球研究人员开发禽流感和季节性流感病毒疫苗（更不用说高产的 H1N1“猪流感”）的数据库，现在正处于其共同创建者之间丑陋裂痕的中心。发起这项工作的全球共享禽流感数据倡议 (GISAID) 基金会和构建了实际流感基因序列“EpiFlu”数据库的瑞士生物信息学研究所 (SIB) 都声称拥有该项目的所有权，这要归功于法律和财务纠葛，现在将由法院来理清。
目前，这场争端导致了两个 EpiFlu 数据库的存在（一个由位于华盛顿特区的 GISAID 基金会于周一启动，另一个由 SIB 管理），这种情况可能会破坏建立中央存储库以改进流感数据共享的目标。
GISAID 宣布计划在 2006 年 H5N1 禽流感爆发后创建原始 EpiFlu 数据库，作为一种为研究人员提供快速访问基因序列数据的方式。然后，该基金会与 SIB 签订合同，进行构建实际数据库所需的编程。
自 2008 年 5 月上线以来，150 多个国家的科学家已将 GISAID EpiFlu 数据库用作关于流感基因序列的免费公共信息共享来源。然而，对于 GISAID 来说，麻烦出现在 7 月 27 日，当时 SIB 切断了从 GISAID.org 网站访问 EpiFlu 数据的权限。SIB 引用“合同和法律问题”，将所有注册用户重定向到 SIB 网站以访问信息。
一位 GISAID 基金会董事会成员表示，“SIB 断开了与我们门户网站的连接，并告诉研究人员直接连接到 SIB”，由于与 SIB 正在美国哥伦比亚特区地方法院进行的诉讼以及在瑞士日内瓦进行的仲裁程序，该成员要求不公开身份。
SIB 主任罗恩·阿佩尔在一份声明中表示，GISAID 没有全额支付其组织的工作费用，并且根据瑞士法律，拖欠付款会使合同无效，从而使 SIB 拥有其构建的数据库的权利。
GISAID 基金会对这一说法提出异议，称 SIB 的工作已由美国疾病控制与预防中心 (CDC) 和瑞士政府支付。据该基金会董事会成员称，SIB“无权这样做或自行运营 EpiFlu 数据库”。
位于北卡罗来纳州研究三角园的 Alphavax 和位于马里兰州罗克维尔的 Novavax, Inc. 等生物技术公司依赖 EpiFlu 数据库中包含的信息来帮助他们开发原型流感疫苗，而无需等待 CDC 发布病毒参考毒株，这在疫情爆发后可能需要几周时间。与更传统的鸡蛋基方法相比，他们的方法有望使他们能够快速、大量地生产疫苗。
EpiFlu 模型类似于开源软件模型，程序员可以使用网络上免费提供的代码片段来构建或改进他们的软件。（开源项目成功的一个主要例子是 Linux 操作系统。）根据EpiFlu 访问条款，所有用户都同意免费共享自己的数据，在使用他人数据时给予适当的致谢，并协同工作。
GISAID 的新流感数据库由 马克斯·普朗克信息学研究所计算生物学和应用算法学部以及内容管理系统软件制造商 a3 systems, GmbH 独立于 SIB 和 WHO 开发。该数据库包含近 30,000 个分离株（或病毒样本）的信息，包括原始数据库（SIB 仍在管理）的内容，以及联合国粮食及农业组织和世界动物卫生组织的兽医参考实验室向 GISAID 贡献的新发现。
GISAID 数据库最初的创建部分是为了解决发展中国家研究人员的投诉，他们说，以前由 WHO 运行的数据共享系统迫使他们在将病毒样本发送给 WHO 时放弃其病毒样本的知识产权。然后，这些病毒样本将被私人制药公司用于制造疫苗，这些疫苗被授予专利并以许多贫困国家无法承受的价格出售，美联社在 2008 年 10 月报道。
GISAID 信息库的另一个推动力来自 2006 年，当时意大利兽医和研究员伊拉里亚·卡普阿透露，在禽流感案例中，WHO 将一些关键信息保存在新墨西哥州洛斯阿拉莫斯的一个私人数据库中，仅供 15 个实验室访问，美联社在 2008 年 5 月报道。