利用抗癌力量集体进行治疗

新泽西州癌症研究所正在与其他机构合作开发软件,使医生和研究人员可以比较病例和治疗结果

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为了改进癌症护理,研究人员今天宣布计划创建一个巨型数据库,旨在让肿瘤学家和科学家共享重要信息。新泽西州癌症研究所 (CINJ) 和罗格斯大学(均位于新不伦瑞克)以及 IBM 正在开发一个计算机系统,使全球的医生和研究人员能够利用癌症研究和治疗的最新进展;他们将其设想为一种工具,帮助医生为患者量身定制最佳疗法,并让科学家追踪先前研究的成功或失败。

特别是,该系统将包含一个癌组织微阵列的数字数据库,可以用于比较新的样本。这将使医生和研究人员能够研究如何治疗类似的癌症以及哪种疗法效果最好

该项目的首席研究员,位于新泽西州皮斯卡塔韦市的 U.M.D.N.J–罗伯特伍德约翰逊医学院生物医学影像与信息学中心主任、病理学和实验室医学教授 David Foran 说,这样的数据库将有助于医生确定在发现恶性肿瘤后最佳的治疗方法。


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组织微阵列允许研究人员一次测试许多活组织检查的切片。“在识别疾病的哪个阶段有哪些蛋白质发挥作用,以及是什么导致疾病发生方面,它在研究和发现中具有极高的价值,”Foran 说。

新的决策支持系统将扩展 CINJ 的“帮助战胜癌症”项目,该项目于 2006 年 7 月启动,旨在开发用于改进组织样本中癌症检测的软件和算法。该项目的初始阶段获得了美国国立卫生研究院 (NIH) 250 万美元的拨款,建立了一个大型数据库,使医生和研究人员能够比较乳腺癌、结肠癌以及头颈癌患者的各种治疗方案。

正在开发的决策支持软件将使该过程更进一步,允许医生和科学家分析和分类标本的数字化组织微阵列图像,并将它们与系统中已有的 100,000 多个样本进行对比。俄亥俄州立大学医学中心将对该软件进行修改,使其可以在研究人员可以访问的计算机网格上运行。CINJ 及其合作伙伴计划扩展该系统,以包含有关其他形式癌症的信息,但尚未确定时间表。

Foran 和他的同事计划通过在 CINJ 和俄亥俄州立大学 (O.S.U.) 使用镜像站点,并在 NIH 的癌症生物医学信息学网格项目 (caBIG) 的支持下,与全国其他癌症研究机构共享这些技术。CINJ 和 O.S.U. 将最初使用网格技术向其机构以及亚利桑那州立大学和宾夕法尼亚大学医学院的癌症研究人员提供对软件和数据库的访问权限。随着项目的进展,访问权限将扩大。

在其初始阶段,“帮助战胜癌症”项目利用了 IBM 世界社区网格的计算能力来创建决策支持系统将访问的表达模式数据库。世界社区网格是一个虚拟超级计算机,其计算资源来自全球数千名志愿者的捐赠,他们将其 PC 的一部分未使用的处理能力提供给该网格。IBM 全球社区倡议副总裁 Robin Willner 说,IBM 于 2004 年 11 月建立了世界社区网格,旨在为那些没有其他方式推进的科学和研究项目提供计算资源。

除了这个研究项目之外,该网格还主办了另外八个主要在生物医学领域的项目,包括那些试图开发治疗 HIV/AIDS、登革热和西尼罗病毒的项目。IBM 正在向 CINJ 捐赠一台高性能 P6 570 系列服务器和一个存储系统,以提供信息技术基础设施,该基础设施将与位于俄亥俄州立大学的计算机分担运行新软件的工作负载。

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