可视化蛋白质结构

本文发表于《大众科学》的前博客网络，反映了作者的观点，不一定反映《大众科学》的观点

科学可视化严重依赖视觉行话。符号可以在特定上下文中携带高度具体的信息，并允许插图画家与精通该语言的其他人有效地交流复杂信息。翻阅任何科学教科书，您都会看到这些符号随着新概念一起出现。例如，学生学习在化学中解释和使用电子轨道图、费曼图在物理学中，以及分支图在古生物学中。

但除了费曼图（可能是因为它们以推广它们的人的名字命名）之外，我很惭愧地承认，我对这些视觉语言的起源故事知之甚少。在我的工作中，我几乎每天都会阅读或使用许多这些符号，但我不知道作者是谁。

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上周——感谢 Sonya Tadrowksi 的一条推文——我在线上认识了另一位作者。用于表示蛋白质结构的带状图是由 简·理查森开发的，她目前是杜克大学的詹姆斯·B·杜克生物化学教授。

正如 Arthur Olson 和 David Goodsell 在 1992 年大众科学 文章“可视化生物分子，”中所说：

“生物化学家经常发现，观察蛋白质链如何折叠成紧凑的分子会很有启发。杜克大学的简·S·理查森推广了一种简单而有效的图形表示方法，该方法遵循蛋白质的整体折叠，但消除了单个原子的混乱缠结。由此产生的带状图有助于将许多不同的蛋白质结构分类为有限数量的不同折叠基序。”

理查森分类系统的一些早期细节发表在  “β-折叠拓扑结构和蛋白质的相关性”中。该论文中的一个图示如下。

理查森的“蛋白质结构的解剖学和分类学”的注释网络版本概述了完整的分类系统（最初发表于Advances in Protein Chemistry，第 34 卷，1981 年）。另请参阅幻灯片 寻找秩序，了解她杜克大学实验室的带状图示例。