本文发表于《大众科学》的前博客网络，反映了作者的观点，不一定反映《大众科学》的观点。
下面的图表引起了我在最近一篇《Quanta Magazine》文章中的注意。由 Lucy Reading-Ikkanda 为 Emily Singer 的 “预测感染代价的新方法” 绘制，它清晰直观地展示了疾病抵抗力强和高风险个体在所谓的“疾病空间”中的路径差异。
鸣谢：Lucy Reading-Ikkanda 为《Quanta Magazine》绘制（出自 Emily Singer 于 2016 年 8 月 30 日发表的 “预测感染代价的新方法”）。
《Quanta》杂志中的图表似乎是一个理想化的关联散点图。也许有点偏向概念艺术领域，因为我不确定我们看到的是否是根据轴刻度绘制的实际值。但这并不困扰我，因为该图表的价值在于它能够用视觉模型解释概念，而不是表示特定的数据集。
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它深深扎根于其引用的研究工作，“通过绘制疾病空间来追踪对感染的抵抗力”，作者是 Brenda Torres、Jose Henrique Oliveira 及其同事，于 2016 年 4 月 18 日发表在《PLOS Biology》上。斯坦福大学和休斯顿大学的研究人员追踪了通过疾病空间的路径，这些路径由诸如红细胞计数和疟疾寄生虫密度等变量表示。抵抗力强的个体形成小环，抵抗力弱的个体形成大环（感染时间更长，症状更严重），并且更容易超出阈值，走向死亡。
疟疾的周期性感染模式——以及某些相关变量的偏移性质（不同的免疫细胞浓度水平不会同时达到峰值或谷底）——使其成为使用此模型进行检查的特别好的疾病，如原始论文所示（如下）。
原始标题：“图 1. 疾病空间图行为预测。
(A) 该图想象了一张地图，描绘了一个抵抗力强的感染个体可能在疾病空间中行进的路径。宿主从舒适的位置开始，但随着病原体负荷增加和健康状况下降，它进入疾病状态。一旦病原体负荷降低，宿主开始积极修复其健康，从而形成一个开放环路，其中路径上的每个位置都是独一无二的。(B) 对于一个系统中，两个参数在一个周期内振荡，它们将在相空间中描绘出三种基本形状。如果参数在时间上不相互重叠，它们将描绘出 L 形曲线（i, iv）。完全重叠产生一条线（ii, v），部分重叠产生一个环（iii, vi）。颜色渐变显示每个参数的浓度增加。另请参见 S1 图。”鸣谢：Torres BY, Oliveira JHM, Thomas Tate A, Rath P, Cumnock K 等。(2016) 通过绘制疾病空间来追踪对感染的抵抗力。《PLoS Biology》14(4): e1002436. doi:10.1371/journal.pbio.1002436
事实上，对于感染疟疾的个体来说，疾病空间中的路径对于某些关键指标来说大致是圆形的，而不是随着时间推移沿着直线来回摆动。
原始标题：“图 2. 感染疟疾小鼠的疾病空间图。(A) 在蓝色标记的时间轴上绘制了三只小鼠的八个参数的平均值（每日测量并平均，持续 20 天）。单独绘制的三只小鼠的路径显示在 S2 图中。用于定义 B 细胞、NK 细胞、粒细胞和网织红细胞的转录标记分别是 Cd79b、Nkg7、Camp 和 Trim 10，它们以 log2 值报告。时间由曲线厚度的增加表示。(B,C) 代表性环状参数对的相图。请注意，轴已翻转，以便所有图表都从顶部开始，并且患病小鼠沿着相空间中的顺时针路径移动。该图显示了“舒适”（第 0-6 天，绿色）、“患病”（第 7-10 天，蓝色）和“恢复”（第 11-15 天，黄色）区域。”鸣谢：Torres BY, Oliveira JHM, Thomas Tate A, Rath P, Cumnock K 等。(2016) 通过绘制疾病空间来追踪对感染的抵抗力。《PLoS Biology》14(4): e1002436. doi:10.1371/journal.pbio.1002436
原始标题：“图 4. 疾病空间扭曲的小鼠的疾病图。(A) 感染疟疾小鼠的拓扑网络图，追踪小鼠感染后最多 26 天。存活的小鼠标记为蓝色 (n = 3)，而死亡的小鼠标记为红色 (n = 4)；其他颜色显示地图中的重叠部分。(B-C) 显示与 (A) 相同的疾病图，但根据 (B) 时间或 (C) 网织红细胞（亚铁螯合酶）着色。寄生虫密度与 RBC (D) 以及 Fech 与 RBC (E) 的参数的相图，这些参数在垂死小鼠的环状系统中发生偏差。请注意，轴已排列 (D-E)，以便所有图表都从左上角开始，并且患病小鼠沿着相空间中的顺时针路径移动。该图显示了“舒适”（第 0-6 天，绿色）、“患病”（第 7-10 天，蓝色）和“恢复”（第 11-15 天，黄色）区域。未被存活小鼠路径包围的区域被涂成红色，并揭示了垂死小鼠经过的危险空间。与幸存者使用的细线相比，垂死小鼠的路径用粗线勾勒出来。(A-C) 的范围和导出图表的参数列在 S8 表中。”鸣谢：Torres BY, Oliveira JHM, Thomas Tate A, Rath P, Cumnock K 等。(2016) 通过绘制疾病空间来追踪对感染的抵抗力。《PLoS Biology》14(4): e1002436. doi:10.1371/journal.pbio.1002436
《Quanta》杂志的图表是一种理想化的形式，反映了原始研究论文的图 2C 和图 4E 中呈现的信息，所有这些图都绘制了红细胞浓度与未成熟红细胞（网织红细胞）浓度的关系。结果；为非专业受众提供了一个简洁的总结图。