利用细菌帮助防止土壤侵蚀——iGEM 区域冠军的客座文章

这是一篇来自伦敦帝国理工学院 iGEM 竞赛团队成员的客座文章。他们最近赢得了 iGEM 区域冠军赛,并将于 11 月前往波士顿参加全球总决赛。

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这是一篇来自iGEM 竞赛团队(来自伦敦帝国理工学院)成员的客座文章。他们最近赢得了 iGEM 区域冠军赛,并将于 11 月前往波士顿参加全球总决赛。这篇文章描述了他们夏季所做的工作,以及他们对 iGEM 经历的感受。

夏天怎么样?我们不知道。我们在开发 iGEM 竞赛项目时错过了大部分夏天。不过我们不后悔,因为我们在 iGEM 欧洲区域性盛会上获得了大奖,这让所有的努力都值得了。

对于那些不了解 iGEM 的人来说,iGEM 代表国际基因工程机器大赛,这是一项全球本科生团队之间的竞赛。挑战在于开发一个合成生物学系统,并在团队设计的网站上以及通过演示和海报展示来展示结果。然后,各团队前往区域性盛会,在那里他们会被“称重”、评估并颁发奖项。顶尖团队将赢得在波士顿举行的全球总决赛盛会的参赛资格,并有机会赢得大奖:令人垂涎的 BioBrick 奖杯。


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上周末,我们飞往阿姆斯特丹参加在阿姆斯特丹自由大学举办的欧洲盛会,我必须说,这太精彩了!我们获得了与来自欧洲和非洲各地的团队会面的绝佳机会,并讨论了他们正在进行的项目。在观看了一天如此精彩的演示之后,获得大奖简直是锦上添花。我们的项目 AuxIn 旨在通过使用细菌刺激植物根系生长来对抗荒漠化蔓延。增加的根系质量有助于固定土壤,防止土壤被风或雨水侵蚀。通过帮助植物建立强大的根系,我们可以帮助全球各地正在实施的现有植被恢复项目。

该系统由三个模块组成,我们将其命名为 PhytoRouteAuxin XpressGeneGuard。在 PhytoRoute 中,我们表达了一种对植物根系释放的化学物质敏感的受体。这与大肠杆菌的天然趋化性机制结合,使我们的细菌游向植物根部。

Auxin Xpress 是我们用于分泌植物生长因子——生长素的模块。为此,我们从细菌Pseudomonas savastanoi中提取出生长素生产途径,并在我们的大肠杆菌细胞中表达,我们正在将大肠杆菌用作我们系统的“底盘”。

我们的第三个模块 Gene Guard 诞生于围绕我们系统的人为实践。为了实施我们的项目,我们需要将细菌释放到环境中。虽然我们咨询了生态学家和其他专家关于这可能产生的影响,但仍然一直存在着我们的基因构建体传播到本地土壤细菌的担忧。因此,为了防止水平基因转移,我们在我们的 AuxIn 质粒上表达了一种毒素,该毒素会导致任何吸收该质粒的细菌发生细胞裂解。除了我们的细菌之外的任何细菌都会裂解,因为我们的细菌从它们的基因组中表达抗毒素,而抗毒素无法传递给其他细菌。

当然,这仅仅是我们正在进行的工作的冰山一角;您可以在 我们的 wiki 上查看更多详细信息。

老实说,我认为这个消息还没有完全消化,但我知道我永远不会忘记当我们的名字被宣布,团队其他成员都跳起来庆祝的那一刻。不过,那还不是 iGEM 经历中最棒的部分。这个夏天是我一生中最美好的夏天之一,这都要归功于我的队友和顾问们让它变得如此有趣。致正在阅读这篇文章的本科生们:参加 iGEM 吧。即使你必须组建自己的团队,也要去做。你会喜欢它的每一分钟。

然而,我们不是那种会固步自封的人,我们目前正在回到实验室,为 11 月的全球总决赛盛会做准备。现在我们都开始上课了,这将变得更加困难,所以我们将不得不放弃我们所剩无几的空闲时间。您可以在 我们的 wiki 上查看我们的进展,或者在 Twitter 上关注我们 @ImperialiGEM11

祝我们好运!

About S.E. Gould

A biochemist with a love of microbiology, the Lab Rat enjoys exploring, reading about and writing about bacteria. Having finally managed to tear herself away from university, she now works for a small company in Cambridge where she turns data into manageable words and awesome graphs.

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