本文发表于《大众科学》的前博客网络,反映了作者的观点,不一定反映《大众科学》的观点
DNA 是重要的物质。它存在于地球上所有生物体中(或者如果你想和病毒学家保持友好关系,可以说“几乎所有”),并且包含产生和组织细胞内蛋白质所需的信息。如果 DNA 受损,细胞将很快发现自己处于危险之中。在多细胞生物中,一个细胞失控的后果是如此灾难性,以至于对于除非常简单的 DNA 损伤以外的任何情况,通常的反应是受损细胞进行光荣的自杀。
在单细胞细菌中,DNA 损伤的后果仅影响该细胞本身,并且由于细胞的内部组织更具灵活性,因此细胞可以容忍稍微粗糙的 DNA 修复。在某些情况下,这甚至可能是一种优势;DNA 的改变可能导致新的基因或基因组合,这可能对细菌有利。
细菌对 DNA 损伤的反应被称为 SOS 反应。其中涉及两种主要蛋白质——一种是 LexA,在细胞健康时保持反应关闭,另一种是 RecA,在 DNA 损伤发生时将其打开。在正常的健康细胞中,LexA 蛋白与细菌 DNA 的特定部分(称为“SOS 盒”)结合,“SOS 盒”编码超过 50 个基因,而 RecA 在细胞周围漂浮,寻找受损的 DNA。如果它找到任何受损 DNA,它就会与之结合并刺激 LexA 蛋白的分解。因此,SOS 盒基因被释放,并且可以制造处理 DNA 损伤的蛋白质。
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尽管所有 SOS 基因最终都会被激活,但它们并非同时开启。首先产生的蛋白质是那些修复简单 DNA 损伤的蛋白质,例如单核苷酸的问题。然后产生更多的 LexA;如果问题已解决,则不需要进一步的基因。如果仍然存在显着的 DNA 损伤,细胞开始产生低保真 DNA 聚合酶。高保真 DNA 聚合酶用于复制 DNA,并从遗传密码产生蛋白质。这些低保真聚合酶相当于蹩脚的建筑工人,随意地将旧核苷酸拼凑在一起,使 DNA 恢复完整。
这些低保真聚合酶可能看起来有点草率,但由于保真度低,它们可以修复那些损坏严重的 DNA 片段,以至于高保真聚合酶会停滞或卡住。乍一看,DNA 不能更准确地修复似乎很不幸,但这些低保真聚合酶实际上是一种秘密武器。通过在 DNA 中进行粗糙的、容易出错的修补,它们提高了突变率。如果细菌正在经历严重的 DNA 损伤,那么这些突变有可能产生一些有用的东西。这是一种在压力时期进行即时进化的方式。
除了试图修复受损的 DNA 外,SOS 反应还参与了许多其他对细胞损伤的令人兴奋的反应。在大肠杆菌中,SOS 盒开启促进细胞休眠和静止的蛋白质。它还可以导致细胞形成生物膜,并且在某些细菌中,它开启抗生素抗性基因的产生。
鉴于此,已经完成了一些关于阻断细菌 SOS 反应的有趣工作。虽然这不会杀死细菌,也不会阻止它们传播,但它会阻止细菌对某些抗生素治疗做出充分反应。通过这种方式,阻断 SOS 反应的物质可以延长抗生素的寿命,或者允许使用效力较低的抗生素来治疗细菌性疾病。
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参考文献
1: Žgur-Bertok D (2013) DNA 损伤修复和细菌病原体。PLoS Pathog 9(11): e1003711. doi:10.1371/journal.ppat.1003711
2: Edelweiss E, Balandin TG 等人 Barnase 作为一种触发人类癌细胞凋亡的新型治疗剂 PLoS One. 2008 Jun 18;3(6):e2434.