林道诺贝尔奖会议——Joke van Bemmel,染色质与表观遗传学

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这篇文章发表于《大众科学》的前博客网络,反映了作者的观点,不一定反映《大众科学》的观点。


Joke van Bemmel(想象一下用荷兰口音怎么说 - 'y' 发 'j' 的音),是来自阿姆斯特丹荷兰癌症研究所的研究员。这位充满热情的 29 岁 van Bemmel 即将完成她的博士学位,目前正在申请寻找理想的博士后职位。她的梦想是:“只是做好的、酷的、有趣的科学。”

她很高兴告诉我关于染色质研究,这是她与实验室其他人一起完成的研究,去年发表在Cell杂志上。染色质是细胞核内蛋白质和 DNA 的结合,并且“对于转录的调控非常重要”,研究人员写道。Van Bemmel 告诉我,现在说对染色质类型的基本研究将产生什么样的影响还为时过早。

当我们坐在林道漂亮的海港边时,我们讨论了到目前为止会议中提出的一些重大问题,以及她的职业生涯走向。阅读我们对话的文字记录如下:


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问:您如何看待用于增强智力的认知增强药物——如果它们没有副作用?

这是一个伦理问题!直觉上,我会反对它。这只是一种直觉。我认为每个人都有自己的天赋,在不同的层面上——可能是音乐才能,可能是木工。智力有很多种;如果你以这种方式谈论药物,它只是一种智力。

问:细菌抗生素耐药性是否像媒体描述的那样构成巨大威胁?

是的,因为越来越清楚地表明我们确实存在问题。耐药性不断变化,我们无法跟上它的步伐。正如我们在会议上听到的那样——诺贝尔奖获得者 Ada Yonath 关于核糖体的演讲就是一个很好的例子。[Yonath 说,抗生素耐药性“几乎是医学中最可怕和最大的问题。”]

问:目前医学/生理学领域最热门的研究领域是什么?

我认为目前的研究方向是实验室工作与大数据集的结合。不再是单个基因、单个相互作用或单个位点……一切都走向全基因组。在蛋白质组学中,同时研究多种蛋白质。端粒酶的演讲也是如此,诺贝尔奖获得者 Elizabeth Blackburn 在演讲中谈到了用机器人同时检测许多人的端粒。我认为这就是未来的方向,建模数据、分析大数据集和实验室工作的结合。

问:到目前为止,人类健康是否因基因组测序而得到改善?

我不确定我是否能说它受益多少,但它受益的程度低于预期。最初的想法是,一旦我们了解了基因组,我们就能够做任何事情,一切都在基因组中。但是,它似乎并没有所有的答案。即使你了解基因组,你仍然不知道所有的编码区域,即使你知道它们——调控中还有很多事情发生。这些事情比人类基因组计划时期认为的要重要得多。

[然而,] 许多不同基因组序列的可用性确实对该领域的研究做出了很大贡献。因此,这是一种贡献,但它不是一切的答案。当然,谈到个性化医疗,它确实对这部分有所贡献:如果你知道一个人有什么突变,什么类型的癌症,你就可以预测哪种类型的治疗会有效,哪种不会。

问:您能谈谈您的研究吗?

 

这又回到了我说的了解基因组并不能让你了解一切的观点。因此,我们研究染色质,它是蛋白质与 DNA 的结合,这些蛋白质影响基因的表达水平和基因组的包装。我们想知道的是:我们能否生成染色质作用的全局图景?已经观察到存在非活性和活性染色质,并且被转录的 DNA 与关闭的 DNA 的包装方式不同……我们选取了许多蛋白质,并决定检查它们与基因组的结合位置,然后我们用 53 种蛋白质做到了这一点。我们研究了不同的组合,实际上发现了五种不同类型的组合。这非常酷。

 

我们发现实际上有两种不同的活性类型,并且它还与不同的基因功能相关:其中一种与管家基因有关,即你在每种细胞类型中始终需要的那种,另一种则更具组织特异性,调控也更具体。第五种是完全非活性类型,比已知的两种非活性类型更非活性。这是一个很好的发现。

问:您的研究有何意义?

 

这仍然是一个长远的目标,因为这是在果蝇Drosophila 基因组中完成的,因为果蝇的基因组小得多,同源物也较少。如果你想在人类身上做同样的事情,你需要更多不同类型的蛋白质,所以直接来说,我想不出任何东西。但是,了解事物的调控方式,就为了解哪些地方出了问题打开了道路。在癌症中,不仅会发生突变,而且还有很多基于基因调控或表观遗传学而出错的事情。

 

注:表观遗传学有点棘手,我们只研究了一组细胞。这可能会令人困惑,但它密切相关。我们研究了一种细胞类型,而不是遗传性。

 

问:您对未来的愿望是什么?

 

我确信那将是做好的、酷的、有趣的科学。我肯定会尝试留在科学领域——我非常喜欢它。我喜欢一位诺贝尔奖获得者昨晚说的话:“尝试一下,看看会发生什么——你总是可以像其他人一样找到一份真正的工作”。他可能是对的。我们都在做我们真正喜欢的事情,我们应该这样做,并在它持续的时候享受它——我希望它能持续很长时间。

 

问:您职业生涯中最大的挑战是什么?

 

在科学领域,你总是可以学习并从同事那里获得建议,我们都渴望学习。你可以花时间在上面,它非常灵活。所以我认为最大的挑战只是找到正确的职业道路——同时拥有个人生活!

 

问:您对这次会议感觉如何?

 

我喜欢的是,每位获奖者对演讲都有不同的看法:有些人做鼓舞人心的演讲,你可以放松地坐着,而且很有趣;或者有些人关注他们也有私人生活和家庭这一事实,听到即使是诺贝尔奖获得者也有生活,这令人感到欣慰;还有一些人会告诉你一些你还不了解的领域。这很愉快。

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关于作者: Christine Ottery 是一位自由科学作家,为卫报TheEcologist.co.ukSciDev.net连线杂志撰稿。她最近毕业于英国伦敦城市大学的科学新闻硕士专业。她的博客是 Open Minds and Parachutes,推特账号是 @christineottery。

文中表达的观点是作者的观点,不一定代表《大众科学》的观点。

交叉发布在林道诺贝尔奖社区的官方网站上——林道会议的互动之家:研究人员肖像:Joke van Bemmel

Christine Ottery is a journalist with a very broad range interests and a MA in science journalism from City University. In the past year she has written about art and science for the New Scientist, technology for Wired UK, neuroscience for the Dana Foundation, international development for SciDev.net, 'the female Viagra' for Comment is Free, and the environment for TheEcologist.co.uk and the Guardian. On top of all this, Christine has been known to blog, tweet, present podcasts, deliver talks and film and produce for online broadcast.

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