这篇文章发表于《大众科学》的前博客网络,反映了作者的观点,不一定反映《大众科学》的观点。
Joke van Bemmel(想象一下用荷兰口音怎么说 - 'y' 发 'j' 的音),是来自阿姆斯特丹荷兰癌症研究所的研究员。这位充满热情的 29 岁 van Bemmel 即将完成她的博士学位,目前正在申请寻找理想的博士后职位。她的梦想是:“只是做好的、酷的、有趣的科学。”
她很高兴告诉我关于染色质研究,这是她与实验室其他人一起完成的研究,去年发表在Cell杂志上。染色质是细胞核内蛋白质和 DNA 的结合,并且“对于转录的调控非常重要”,研究人员写道。Van Bemmel 告诉我,现在说对染色质类型的基本研究将产生什么样的影响还为时过早。
当我们坐在林道漂亮的海港边时,我们讨论了到目前为止会议中提出的一些重大问题,以及她的职业生涯走向。阅读我们对话的文字记录如下:
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问:您如何看待用于增强智力的认知增强药物——如果它们没有副作用?
这是一个伦理问题!直觉上,我会反对它。这只是一种直觉。我认为每个人都有自己的天赋,在不同的层面上——可能是音乐才能,可能是木工。智力有很多种;如果你以这种方式谈论药物,它只是一种智力。
问:细菌抗生素耐药性是否像媒体描述的那样构成巨大威胁?
是的,因为越来越清楚地表明我们确实存在问题。耐药性不断变化,我们无法跟上它的步伐。正如我们在会议上听到的那样——诺贝尔奖获得者 Ada Yonath 关于核糖体的演讲就是一个很好的例子。[Yonath 说,抗生素耐药性“几乎是医学中最可怕和最大的问题。”]
问:目前医学/生理学领域最热门的研究领域是什么?
我认为目前的研究方向是实验室工作与大数据集的结合。不再是单个基因、单个相互作用或单个位点……一切都走向全基因组。在蛋白质组学中,同时研究多种蛋白质。端粒酶的演讲也是如此,诺贝尔奖获得者 Elizabeth Blackburn 在演讲中谈到了用机器人同时检测许多人的端粒。我认为这就是未来的方向,建模数据、分析大数据集和实验室工作的结合。
问:到目前为止,人类健康是否因基因组测序而得到改善?
我不确定我是否能说它受益多少,但它受益的程度低于预期。最初的想法是,一旦我们了解了基因组,我们就能够做任何事情,一切都在基因组中。但是,它似乎并没有所有的答案。即使你了解基因组,你仍然不知道所有的编码区域,即使你知道它们——调控中还有很多事情发生。这些事情比人类基因组计划时期认为的要重要得多。
[然而,] 许多不同基因组序列的可用性确实对该领域的研究做出了很大贡献。因此,这是一种贡献,但它不是一切的答案。当然,谈到个性化医疗,它确实对这部分有所贡献:如果你知道一个人有什么突变,什么类型的癌症,你就可以预测哪种类型的治疗会有效,哪种不会。
问:您能谈谈您的研究吗?
这又回到了我说的了解基因组并不能让你了解一切的观点。因此,我们研究染色质,它是蛋白质与 DNA 的结合,这些蛋白质影响基因的表达水平和基因组的包装。我们想知道的是:我们能否生成染色质作用的全局图景?已经观察到存在非活性和活性染色质,并且被转录的 DNA 与关闭的 DNA 的包装方式不同……我们选取了许多蛋白质,并决定检查它们与基因组的结合位置,然后我们用 53 种蛋白质做到了这一点。我们研究了不同的组合,实际上发现了五种不同类型的组合。这非常酷。
我们发现实际上有两种不同的活性类型,并且它还与不同的基因功能相关:其中一种与管家基因有关,即你在每种细胞类型中始终需要的那种,另一种则更具组织特异性,调控也更具体。第五种是完全非活性类型,比已知的两种非活性类型更非活性。这是一个很好的发现。
问:您的研究有何意义?
这仍然是一个长远的目标,因为这是在果蝇Drosophila 基因组中完成的,因为果蝇的基因组小得多,同源物也较少。如果你想在人类身上做同样的事情,你需要更多不同类型的蛋白质,所以直接来说,我想不出任何东西。但是,了解事物的调控方式,就为了解哪些地方出了问题打开了道路。在癌症中,不仅会发生突变,而且还有很多基于基因调控或表观遗传学而出错的事情。
注:表观遗传学有点棘手,我们只研究了一组细胞。这可能会令人困惑,但它密切相关。我们研究了一种细胞类型,而不是遗传性。
问:您对未来的愿望是什么?
我确信那将是做好的、酷的、有趣的科学。我肯定会尝试留在科学领域——我非常喜欢它。我喜欢一位诺贝尔奖获得者昨晚说的话:“尝试一下,看看会发生什么——你总是可以像其他人一样找到一份真正的工作”。他可能是对的。我们都在做我们真正喜欢的事情,我们应该这样做,并在它持续的时候享受它——我希望它能持续很长时间。
问:您职业生涯中最大的挑战是什么?
在科学领域,你总是可以学习并从同事那里获得建议,我们都渴望学习。你可以花时间在上面,它非常灵活。所以我认为最大的挑战只是找到正确的职业道路——同时拥有个人生活!
问:您对这次会议感觉如何?
我喜欢的是,每位获奖者对演讲都有不同的看法:有些人做鼓舞人心的演讲,你可以放松地坐着,而且很有趣;或者有些人关注他们也有私人生活和家庭这一事实,听到即使是诺贝尔奖获得者也有生活,这令人感到欣慰;还有一些人会告诉你一些你还不了解的领域。这很愉快。
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关于作者: Christine Ottery 是一位自由科学作家,为卫报、TheEcologist.co.uk、SciDev.net 和连线杂志撰稿。她最近毕业于英国伦敦城市大学的科学新闻硕士专业。她的博客是 Open Minds and Parachutes,推特账号是 @christineottery。
文中表达的观点是作者的观点,不一定代表《大众科学》的观点。
交叉发布在林道诺贝尔奖社区的官方网站上——林道会议的互动之家:研究人员肖像:Joke van Bemmel