开放科学实验——我的发酵日志

我坚信,科学,特别是用公共资金进行的学术科学,应该向所有人开放。

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本文发表于《大众科学》的前博客网络,反映了作者的观点,不一定代表《大众科学》的观点


我坚信,科学,特别是用公共资金进行的学术科学,应该向所有人开放。我有点处于这种信念的激进边缘,因为我认为不仅应该分享已发表的结果,还应该分享实验室笔记和正在进行中的工作。

唉,由于科学也是协作性的,我实际上不能自己做出这个选择。开放性存在结构性障碍——也就是说,由于发表物是唯一重要的货币,泄露的数据/想法可能会被其他人抢走。如果他们发表了,就没有机制让我因为我产生的东西而获得认可。在我幻想的未来,科学出版物可以链接到博客文章/个人网页作为引用(这样我的帖子就可以有“影响因子”),但这并非我们所处的世界。

当(希望有一天)我有了自己的实验室时,我打算无论如何都参与这种激进的开放性,但科学的协作性质意味着我几乎永远不能仅仅为自己做出这个决定。我必须向学生、博士后和合作者披露这种情况,我怀疑很多人不愿意承担风险。而且我当然不能在我仍然只是一个博士后的时候就采取这种立场。如果我分享我实验室的想法/结果,我不仅会冒着自己职业发展的风险,还会冒着我的PI和实验室其他成员的风险。


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所以,我不能告诉你我在实验室里做什么(它涉及到奶酪和奶酪微生物!)。但我可以告诉你我自己的发酵实验。而且我已经做过。为了尝试使用开放的实验笔记本,并且因为我不能每次开始新的发酵就写一篇帖子(说真的,我目前有大约5个在进行中),我正在分享我的印象笔记发酵笔记本

我还正在创建一个个人博客,用于讨论开放科学、我在python编码方面的冒险(我正在为实验室做一些基本的生物信息学)和其他东西。敬请期待!

Kevin Bonham is a Curriculum Fellow in the Microbiology and Immunobiology department at Harvard Medical school. He received his PhD from Harvard, where he studied how the cells of the immune system detect the presence of infectious microbes. Find him on Google+, Reddit.

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