这种珍稀鸟类中的每一只都将完成基因组测序

一项众筹活动希望揭示关于最后125只鸮鹦鹉的隐藏秘密

照片:Dianne Mason,新西兰环保部

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本文发表于《大众科学》的前博客网络,反映了作者的观点,不一定反映《大众科学》的观点


在世界各地,圈养和繁殖的动物往往通过一种称为谱系簿的技术进行管理。这些长达数十年的记录跟踪哪些雄性与哪些雌性交配,以及它们的结合产生了哪些后代。谱系簿帮助动物园和其他保护组织确保他们照顾的动物不会近亲繁殖并最终患上严重的遗传缺陷,并确保它们的后代在未来几年保持尽可能健康的状态。

新西兰即将把谱系簿的概念提升到一个全新的水平,并将其基因应用于一种生活在野外的物种。

嗯,有点像。世界上最后的125只鸮鹦鹉(Strigops habroptila)都生活在一系列受保护岛屿上的半野生状态。这些大型、不会飞的鸟类——大约每三年才繁殖一次——的繁殖已经得到 carefully 管理,但这不一定足够。


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哎呀,当一个物种只剩下125只鸟,而且它们都来自几十年前侥幸逃脱灭绝的少数个体时,你需要尽一切努力确保每一次可能的交配都能产生最好的雏鸟。

遗传学登场了。一只名叫简的雌性鸮鹦鹉最近成为其物种中第一个完成基因组测序的成员。她不会是最后一个。一项新计划希望对所有其他124只鸮鹦鹉进行基因组测序,这项工作将耗资10万美元。他们目前正在通过科学研究众筹平台Experiment筹集4.5万美元,用于对一批40只较老的鸟类进行测序。剩余资金将由遗传拯救基金会资助,该基金会正在接受400美元的捐款,用于对单个鸮鹦鹉进行基因组测序,包括西罗科,这个物种举世闻名的代言鸟。

如果成功,这将是首次对一个物种的每一个成员都进行基因组测序。

测试将由奥塔哥大学的新西兰基因组学有限公司进行。第一批40个样本最早可能在今年三月完成。

鸮鹦鹉恢复计划——该组织管理着所有保护和保存该物种的工作——表示,基因研究将提供几个关键信息。首先,他们将更好地了解哪些鸟类彼此相关,甚至比目前的族谱更好地了解,该族谱跟踪该组织所谓的“一个大家庭”。

其次,基因测试将使他们能够识别功能性的鸮鹦鹉基因,例如任何可能影响生育能力或疾病易感性的基因。

最后,这些测试可能有助于识别任何携带稀有等位基因的个体。这些遗传变异可能是需要在遗传谱系中保留的东西,甚至可能是为了维持物种健康而需要淘汰的基因。

这一切都发生在2016年鸮鹦鹉繁殖季之前,这可能是近年来最好的一次。鸮鹦鹉只在罗汉松树(Dacrydium cupressinum)果实供应充足的季节繁殖。今年是罗汉松树的好年景,因此鸮鹦鹉恢复基金会报告说,至少有15只雌性鸮鹦鹉已经交配,其中一只已经产下三枚可育的卵。

今年繁殖季产生的任何雏鸟至少要六年才能开始繁殖,但到那时,一个由基因信息加强的增强型谱系簿肯定会成为现实。毫无疑问,这将有助于未来几十年的保护工作:鸮鹦鹉的寿命估计可达95年。考虑到这个物种正继续从灭绝的边缘向前攀登,这些基因组测试将帮助很多潜在的未来雏鸟。

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John R. Platt is the editor of The Revelator. An award-winning environmental journalist, his work has appeared in 大众科学, Audubon, Motherboard, and numerous other magazines and publications. His "Extinction Countdown" column has run continuously since 2004 and has covered news and science related to more than 1,000 endangered species. John lives on the outskirts of Portland, Ore., where he finds himself surrounded by animals and cartoonists.

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