本文发表于《大众科学》的前博客平台，反映作者的观点，不一定代表《大众科学》的观点。
每年我都会邀请一些 ScienceOnline 会议的参会者，让他们更详细地介绍他们自己、他们的职业生涯、当前的项目以及他们对网络在科学、科学教育或科学传播中的看法。现在我们继续采访 ScienceOnline2012 的参与者。查看本系列所有访谈请点击 此处。
今天我的嘉宾是肖恩·埃金斯。肖恩·埃金斯是一位科学家，他在 Collaborations in Chemistry 工作，同时以 CollabChem 的名义写博客和发推文。他与世界各地的其他科学家合作进行药物发现、毒理学计算方法、协作工具、科学移动应用程序（绿色溶剂、开放药物发现团队、TB Mobile）。他是美国三所大学（北卡罗来纳大学教堂山分校、马里兰大学和 UMDNJ）的兼职教师，并在多家公司和组织（如 Pistoia Alliance）的董事会任职。他目前专注于被忽视的疾病研究，以及我们如何为罕见疾病公开进行药物发现。他专注于技术，大部分时间都在写作，偶尔也会赢得 SBIR 和 STTR 资助，以便他合作的团队能够进一步发展他们的想法。他喜欢和朋友一起喝杯好啤酒，也喜欢给两个年幼的孩子读书。
欢迎来到“环绕时钟的博客”。请您向我的读者详细介绍一下您自己好吗？您来自哪里（地理位置和哲学思想方面）？您的背景是什么？接受过科学教育吗？
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我出生于克利索普斯，在附近的格里姆斯比（一个工业区，就像新泽西州的伊丽莎白，但在英国东海岸）长大，直到 18 岁。我对生物学产生了兴趣，因为我的叔叔在他去医学院的时候把他的一些高中课本留在了我祖父母家，我喜欢翻阅它们。最终，我会学习我小时候读过的同一本书的最新版本。我总是记得克里克和沃森的照片，原因不明。所以我想成为一名医生，但这个想法被扼杀了。我设法大部分考试都不及格（除了生物学），勉强考上了诺丁汉特伦特理工学院。
然后我获得了应用生物学 HND 文凭，并在 Servier（一家法国制药公司，在温莎附近设有一个研发基地）工作了一年，这真的让我重回正轨。之后，我去了阿伯丁大学（苏格兰）攻读临床药理学硕士学位，然后留在那里攻读博士学位。所以我成了一种不同的医生。到那时，我对药物代谢和理解药物如何表现或相互作用的不同模型产生了兴趣，我的目标是在制药行业工作。在 90 年代初期，英国的制药行业开始衰落并急剧萎缩，所以我认为我最好去美国做博士后。1996 年，我来到印第安纳波利斯，在礼来公司工作，这真的让我重新开始了，有点像重生。
请详细介绍一下您迄今为止的职业生涯轨迹：过去和现在有趣的的项目？
因此，一旦来到美国，我便开始在礼来公司做与我在阿伯丁所做的类似的工作，但专注于一种参与药物代谢的酶 (CYP2B6)。基本上这是没人太感兴趣的“弱势群体”。但这给了我一些灵活性，我开始涉足计算软件，以了解哪些分子可能与我的酶结合。我基本上开始了一项新的职业，从事计算药物代谢或化学。我玩得很开心，并意识到我可以对我同事正在研究的每种酶做同样的工作。那是一段疯狂的时期，白天我在实验台工作，晚上在电脑上工作。因此，在集中式数据库出现之前，我从公告板上提取了他们产生的数据（所有数据都在一张纸上），并用它来建模该小组研究的每种酶。
然后我离开去了辉瑞公司，带着自己的团队从事药物-药物相互作用预测工作，同时继续关注计算方面。礼来公司随后迅速聘请我回去领导一个新的计算 ADME/Tox 团队。基本上做着我做博士后时所做的事情，但现在数据集越来越大，因为他们开始对许多毒理学和代谢相关特性进行高通量筛选。到 1999 年，我 100% 成为了一名计算机科学家（使用计算机进行我所有的科学研究）。我也在这个时候开始与学术界的一些人士合作，这使我能够在礼来的专有工作之外发表研究成果，这一直是持续到现在的线索，每年都会增加更多的合作者。
我的下一步是在 2001 年末加入一家初创公司，该公司主要使用计算工具进行药物发现。我在那里待到 2004 年，然后加入了一家软件公司（最终于 2010 年出售给汤森路透），该公司开发系统生物学工具（本质上是将收集到的所有生物学数据联系起来，并将所有基因组学和蛋白质组学数据叠加起来）。我现在更专注于将我的药物-药物相互作用模型整合到这些工具中，并从事资助项目。
正是在这个时候，我开始在家办公，并且一直这样做。到 2004 年，我已经积累了大量关于预测药物相互作用的出版物，因此我在 2005 年获得了阿伯丁大学的 DSc（科学）学位。我的下一个重点转变是获得机会为 Wiley 编辑一本关于药物研究和开发的计算应用的书籍，大约在同一时间。这为我打开了编辑一系列书籍（迄今为止共 10 本）的大门，并与他人合著了另外 3 本关于毒理学计算方面、新兴技术和合作的书籍。
从 2006 年到 2008 年，我为小型公司和初创公司工作，获得资助和合同，从事药物发现和药物经济学方面的工作。然后，我在礼来的老计算化学导师向一家位于旧金山的软件公司推荐了我，该公司正在开发一个供科学家协作的数据库。从那时起，我一直在为他们从事被忽视的疾病（肺结核和疟疾）方面的工作，每周工作 3 天，留出一些时间继续我的学术合作和其他咨询工作。
我很幸运，我的工作周很少变得枯燥。我参与各种各样令人惊叹的项目，例如通过查看与核受体结合的胆汁盐谱并在计算机中对其进行建模来了解不同物种核受体的进化。另一天，我可能会构建人类药物转运蛋白模型，并预测哪些其他药物可能是底物或抑制剂。我可能会预测一家制药公司的哪些分子可能与一种名为 hERG 的离子通道相互作用，以帮助预测可能的心脏毒性（这可以追溯到我在礼来公司的工作）。我也可能会搜索 FDA 批准的药物，看看是否可以找到针对罕见疾病的新用途，或者思考我们可以用作新的科学移动应用程序基础的数据集。而这仅仅是我每周安排的 2 天！
目前什么占据了您最多的时间和热情？您的目标是什么？
我的大部分时间都集中在证明我们可以使用针对结核分枝杆菌筛选的化合物积累的大量数据来构建模型，这些模型反过来可以用于建议要测试的分子。通过这种方式，我们可以显著地减少测试化合物的数量。所有这些数据都是公开可访问的。我还认为，这种方法可以推广到其他研究领域。我们正在积累数据，但学习速度不够快，无法设计下一个实验。当我不做这些事情时，我越来越关注数据质量以及我们认为理所当然的一些事情，例如——为什么 NIH 会发布一个包含重大错误的数据库，或者一个没有结构的潜在药物列表？我将 50% 或更多的时间用于撰写论文以发表我的观察结果，或为公司或与学者一起撰写资助申请。我很少自己写任何东西，所以一切都是合作完成的。
很难准确预测我明年会从事什么工作——我尝试离开某些领域，跳入新的领域，因为我发现某个项目或合作者在做一些有趣的事情，我认为我可以做出贡献。我发现这样做会付出从头开始的代价，与全新的审稿人建立您的信誉等等。您有多少论文、多少引用或您的 h 指数是多少都无关紧要，因为一旦您从事您从未发表过的任何事情（例如，绿色化学或任何其他领域），或者尝试向新期刊投稿，我发现我会在这类过渡性论文上花费大量时间。一旦您被接受，一切都会容易得多。
我喜欢进入新的领域，因为您会看到那些多年专注于该领域的人看不到的东西。例如，绿色溶剂应用程序的出现是由于我有机会参加一个绿色化学会议，并随机选择一个关于绿色溶剂的讲座来听。一个小组花了两年时间整理制药公司的数据，然后只是将其隐藏在 PDF 中。由于我对这个主题完全陌生，我问是否有包含所有数据的应用程序，并在推特上发布了这个想法。蒙特利尔的 Alex Clark 做出了回应，然后在几天内构建了该应用程序并将其发布到应用程序商店。然而，花了将近一年时间才写出一篇关于该主题的论文并被接受，因为我们面临着老牌科学家不理解其价值的艰苦斗争。
所以我想说，我的热情在于进入新的领域，建立自己的地位，并在短时间内发表文章和学习大量知识。我正在与时间赛跑，在罕见疾病方面的工作中，我更加深刻地感受到了这一点，因为大约有 7000 种罕见疾病，但很少有治疗方法，更不用说治愈方法了。我对它们的了解非常少，而 7000 种疾病就像一座珠穆朗玛峰。我遇到了一位患有快速进展性神经系统疾病的孩子的父母，这真的让我停下来思考如何利用我多年来研究的所有工具来帮助他们，我们如何才能加速和颠覆制药研发——实际上，这意味着要将研发速度提升到超过过去 50 年的水平。这又是适应变化的另一个例子，一些爱抱怨的暴发户说让我们试试这种方法。每种罕见疾病的伟大之处在于，儿童的父母或患者可能远远多于研究人员，因此权力平衡掌握在他们手中，他们筹集资金并资助研究人员去做他们需要做的事情等等。
因此，我的目标是尽我所能地进行科学研究来帮助这些人，同时通过免费应用程序或开放论文等方式尽可能多地将我所做的事情重新投入流通。我 2013 年的目标是将我撰写的每一篇论文主要发表在开放期刊上。
您对科学传播的哪个方面和/或网络在科学中的特定用途最感兴趣？
我喜欢在网络上立即发布想法的速度，而不是写论文、接受审稿以及可能在几个月后才看到它付印的过程。我也喜欢能够发表演讲或海报，并将我的幻灯片放在 slideshare、figshare 等网站上，以便任何人都可以找到它们。
我对科学的创造性部分着迷。在进行导致最终论文想法的研究之前，我很少有最终论文想法的远见（或顿悟时刻）。但我可以看到，使用网络和其他工具可能会加速科学发展到撰写也必须自动化或加速的地步。哪些工具可以帮助产生想法？我在电脑上进行我所有的科学研究，我所有的论文都是在电脑上写的……为什么不也让电脑为我提供所有的想法呢？在啤酒垫或餐巾纸背面写字是一回事，但 iPad 是一个好的替代品吗？我曾用手机写博客（很痛苦），在行驶的汽车里用 iPad 写博客（非常慢），所以我认为它实际上并不是“随时随地通过任何设备进行科学传播”。一个固定的位置会有所帮助，一些纸张来起草想法也很方便。当我打字写下这些话时，我正坐在堆满纸张和笔记的笔记本电脑旁。
博客在您的工作中是如何体现的（如果有的话）？社交网络，例如 Twitter、Google Plus 和 Facebook 呢？您是否发现所有这些在线活动对您所做的事情来说是净收益（甚至是必要的）？
我经常写博客，内容涉及我看到的任何科学方面的东西，也许是我自己或其他人的科学出版物。我对协作元素很感兴趣，这可能是我的主题与众不同的地方，即协作角度。
我发现，通过将我正在思考的东西（无论是好是坏）发布到网络上，我可以从中获得即时的满足感。我的博客已经开始了合作，它们促成了许多论文的发表。我甚至有一位 NIH 的高级官员，在我的一篇博客引起他们的注意后，通过电子邮件向我和大约 70 位其他科学家发送了一封咆哮信。如果他们将这封信发布在我的博客上会更好，因为全世界都可以看到他们的想法，而不仅仅是一部分选定的受众。我也曾有其他经验丰富的科学家在我的博客上支持我的观点。
我发推文（我来得很慢），更多的是在会议上，我反过来将其用于产生想法和作为持久的记忆设备。对我来说，它只是技术发展的延伸和营销理念，因为我发布推文链接到博客、幻灯片、海报、论文等……我有网站、LinkedIn 等，这些有助于带来业务，但我的科学合作主要通过我认识的人、他们的关系和个人互动来实现。我发现电子邮件群发、博客和推文偶尔也会带来合作。在我看来，网络是另一个接触人们的工具。我没有生活在其中。我与它共存。
您何时以及如何首次发现科学博客？您最喜欢哪些？您是否在会议上发现了任何很酷的 参会者的科学博客？
我长期以来一直在阅读我的朋友 Antony Williams 的博客“ChemConnector”。几年前，我的妻子向我推荐了“In the Pipeline”，我非常喜欢它，因为它的话题与制药相关，评论通常也很有趣。自从 ScienceOnline 以来，我一直在关注许多参会者，他们指出了许多优秀的博客，因此我的视野开阔了。我必须合理安排使用 Twitter 和 Flipboard 的时间，但我会推荐 David Kroll，他的文章写得非常清楚。
对您来说，ScienceOnline2012 最好的方面是什么？对明年有什么建议？在本次会议上是否发生了任何事情——一个环节、某人说的话或做的事或写的东西——会改变您对科学传播的看法，或者您将带到您的工作、博客阅读和博客写作中的东西？
关于“信息过载”和“开放科学”的环节对我来说是亮点。前者让我想到一个应用程序，它可以将来自网络和 Twitter 的所有信息汇集在一起。我再次有机会与 Alex Clark 合作开发这个应用程序，我们在 2012 年初发布了它，名为 Open Drug Discovery Teams（科学领域的 Flipboard）。我们将其重点放在罕见疾病主题上，以便我们可以帮助人们分享想法、分子和数据，它激发了一项 IndieGoGo 筹款活动、许多海报、一篇论文、一个 Youtube 视频等等。我认为它仍在兴起，并有可能被开发用于其他用途。在过去的一年中，我已将分子和数据推送到其中，因此我可以看到其潜力。如果我没有参加这次会议，我怀疑这个应用程序是否会被开发出来。我很想看看人们会提出哪些与会议直接相关的想法——也许它可以扩展我的理论，即会议现在与其说是社交网络，不如说是有用的想法生成器。
来自社区的其他博客的标准使我提高了我发布内容的质量，我还有很长的路要走，但如果我写的东西能让某人有心情尝试一些计算工具或联系合作，我就会有所成就。因此，如果下次会议上有需要客座博主或有人将他们的数据扔给我进行建模的人，请联系我。如果您有改进我发布内容的想法，我也想听到。
Antony Williams 让我意识到，博客和我们在网络上发布的所有内容与所有论文和专利一样重要，因为这也可以用于替代计量学。参加 ScienceOnline2012 让我意识到，还有数百名其他科学家与我处于相同的波长。科学传播很重要，有很多方法可以做到这一点，即使是 Twitter 也可以作为科学工具使用。