尽管关于干细胞的政治辩论仍在继续，但过去18个月里，科学已经取得了巨大进展。在这场活跃的热潮中，黄禹锡及其首尔国立大学的团队因其对这个仍处于萌芽状态的领域的影响而脱颖而出。黄在短时间内取得了显著的进步。
2004年2月，黄禹锡和他的研究小组报告了首个源自克隆人类胚胎的胚胎干细胞系。到2005年5月，他们已使用克隆技术创建了11个干细胞系，每个干细胞系都与一位不同的患者完美基因匹配，这又是首创。2005年8月，他们推出了首只克隆狗。2005年10月，他们宣布了一项面向全球科学家的干细胞库计划。
在这些成就中，第二项成就真正标志着最伟大的生物医学进展，并具有最直接的影响。黄禹锡及其团队从克隆的早期胚胎中提取了干细胞——体内所有细胞的自我更新的祖细胞——这些胚胎是通过将皮肤细胞的细胞核滑入无核卵细胞中制成的。然后，他们进一步证明，干细胞系来源于皮肤细胞供体。这项工作彻底革新了治疗性克隆领域，并可能使其承诺——更好地理解和治疗各种疾病——离现实更近一两步。
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黄禹锡2004年的工作阐明了治疗性克隆的可行性，但他仍在改进他的方案中的缺陷。他的团队最初使用了242个卵子，但在去除卵子的细胞核并换入体细胞的细胞核后，研究人员仅产生了30个囊胚（一周大的胚胎），从中他们仅诱导出一个干细胞系。此外，替代细胞核的来源是卵子捐赠者自身的卵丘细胞，卵丘细胞环绕着卵巢中发育中的卵子。这种方法意味着卵子有可能自发地开始分裂，而不是通过克隆发育。
一年的时间变化真大。尽管囊胚生成量基本保持不变（31个囊胚，最初使用了185个卵子），但黄禹锡的团队能够建立11个干细胞系，比之前的工作提高了10倍。更引人注目的是，每个干细胞系都与11位皮肤细胞供体之一基因匹配。这11位患者——9位患有脊髓损伤，1位患有遗传性免疫缺陷疾病，另1位患有1型糖尿病——包括年龄从2岁到56岁的男性和女性。在10个案例中，皮肤细胞的细胞核与来自生物学上无关的女性的卵子融合（剩下的女性同时提供了自己的卵子和皮肤细胞）。在这项工作之前，没有人知道是否可以使用男性或年轻女孩捐赠的细胞核建立细胞系。
黄禹锡的实验室报告称，这11个干细胞系能够分化成胚胎细胞层的三层结构，这三层结构会发育成体内所有细胞。初步测试还表明，这些细胞系将与患者的免疫系统相容。这一特征对于临床应用至关重要，例如将干细胞（其缺陷已得到纠正）移植回患者体内，但研究人员强调，在这些治疗方法成为可能之前，还需要进行多年的进一步研究。
黄禹锡的成功为许多伦理考量增加了紧迫性，而边缘科学家试图进行生殖性克隆的幽灵仍然挥之不去（黄禹锡坚决谴责此类研究）。但是，如果治疗性克隆确实成为各种疾病治疗的黄金标准，黄禹锡的创新和开创性探索将为此铺平道路。