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抗生素耐药性在医院和社区中构成了严重威胁。为了帮助限制这种风险，白宫科学顾问委员会在一份新报告中表示，医疗保健专业人员应开始对致病细菌的DNA进行测序。借助基因组测序技术，科学家可以了解感染的来源以及它与农场抗生素使用的相关程度，决策者将能够更好地控制这种威胁。
“使用传统的抗生素耐药细菌表征方法，很难回答这些问题。然而，在过去几年中，快速且廉价的DNA测序技术的进步使得从细菌基因组中提取答案成为可能，”报告称。细菌之间的基因差异可以用来勾勒出一个分子“家谱”，这将使研究人员能够追踪爆发的来源，并仔细检查是否存在明显的相似之处或差异。报告称，到目前为止，基因组分析仅在少数调查中发挥了作用。为了扩大规模，报告指出应采取以下几个步骤：专家必须从抗生素耐药细菌中整理出基因组序列的初始参考集合；应该建立一个国家病原体监测实验室网络；为改进的计算方法和工具提供资金；以及美国国立卫生研究院应该维护一个公开可用的基因组信息数据库。
总统科学技术顾问委员会的报告于9月18日发布，同时发布了一项新的行政命令，指示某些联邦机构加大力度对抗抗生素耐药性，以及一项新的对抗耐药细菌的国家战略。白宫还宣布了一项2000万美元的奖金，用于开发快速检测抗生素耐药性感染的方法。白宫科学技术政策办公室主任约翰·霍尔德伦表示，抗生素耐药性的上升是“国家安全和公共卫生的首要任务”。美国疾病控制与预防中心估计，每年至少有23,000人死于此类感染。新的法令旨在帮助支持该委员会的建议。
该委员会的报告，最早于7月份公开讨论，当时尚未最终确定，其中还包含创建新的联邦级跨部门小组的建议，该小组将负责监督对抗抗生素耐药性的进展。这份最终的65页报告呼吁加强对抗生素耐药性增长的监测，更好地管理现有抗生素，并加速开发新的抗生素。新的跨部门小组将负责制定一项为期五年的行动计划，以在2015年2月之前攻击耐药性，并制定衡量进展的指标。
疾病预防控制中心主任汤姆·弗里登表示，白宫控制抗生素耐药性增长的新战略以及今天宣布的其他举措将有助于挽救“数千”人的生命。
该报告发布前约五个月，世界卫生组织得出结论，抗生素耐药细菌现在存在于世界各地。人类患者和农场动物滥用药物助长了这种耐药性的兴起。