美国各地的地方和州卫生部门负责监测社区传染病爆发情况，确保餐厅食品安全，并为性传播疾病提供无需预约的免疫接种和诊所。然而，自2007年金融危机开始以来，美国40%的卫生部门遭受了严重的预算削减，迫使他们裁减了四分之一的员工。许多专家担心，这些削减措施正使美国面临流行病风险。
以佛罗里达州杜瓦尔县为例：该县正处于美国20年来最严重的肺结核爆发之中，然而在三月份，佛罗里达州州长里克·斯科特签署了一项法案，缩减州卫生部门规模并关闭了A. G. Holley州立医院，该医院专门治疗未按医嘱服药的肺结核患者，这种做法会引发耐药性。（佛罗里达州参议院议长迈克·哈里多波洛斯曾表示，该预算有助于使该州“对企业主和企业家更具吸引力”，部分原因是它没有增加税收。）“疫情爆发的人群正是通常会成为A. G. Holley医院收治对象的那些人，”佛罗里达州公共卫生协会前主席马克·亚赫特说。据佛罗里达州公共卫生部报告，一些患者已被转移到其他医院，四名出院的患者被认为不具有传染性，卫生工作者正在每天对其进行检查。
在加利福尼亚州，该州肺结核病例占全美五分之一以上，最近的预算削减迫使超过四分之一的地方卫生部门削减了针对该疾病的基本临床服务和监测。“我们正在为疫情的卷土重来埋下隐患，”阿拉米达县公共卫生部门前肺结核控制主管罗伯特·本杰明说。美国疾病控制与预防中心估计，超过1100万美国人（其中包括250万加州人）患有潜伏性肺结核感染，这些感染可能会转为活动性。
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免疫接种服务也受到了严重打击。华盛顿州斯诺霍米什县是2011年3月开始的正在进行的百日咳（咳嗽）爆发的中心。为了遏制其蔓延（百日咳可能导致幼儿死亡），该县卫生部门建议儿童和成人接种疫苗。然而，2009年的预算削减迫使该部门将其免疫接种诊所的服务时间减半，并裁减了30%的全职员工。得克萨斯州蒙哥马利县最近取消了一项为儿童提供免费或低成本疫苗的年度活动——考虑到得克萨斯州有三分之一的幼儿没有接种所有推荐的疫苗，这是一个问题。这场危机促使美国医学研究所（Institute of Medicine）在华盛顿特区召开会议，讨论卫生部门如何在资源日益减少的情况下继续提供基本服务。
对卫生部门职责缺乏认识是导致资金困境的原因之一。“当部门工作做得好时，什么都不会发生，”全国县市卫生官员协会执行主任罗伯特·佩斯特朗克说。然而，他认为，卫生部门与警察和消防部门同等重要。“我们可能不穿制服，”斯诺霍米什卫生区主任加里·戈尔德鲍姆说，“但我们也在做救命的工作。”