将有毒的河豚鱼红鳍东方鲀作为比较对象似乎不太可能,但它将告诉我们很多关于我们自身的信息。这是由一个国际研究联盟所说的,他们在加利福尼亚州圣地亚哥举行的第13届国际基因组测序与分析会议上宣布了这种生物基因组的测序结果。
河豚鱼基因组基本上包含与人类基因组相同的基因和调控序列——但没有所有所谓的垃圾 DNA。事实上,人类基因组包含近 30 亿个碱基对,而河豚的基因组只有 3.65 亿个这样的信息单位。科学家们表示,有了紧凑的河豚基因组作为指导,在相对杂乱的人类基因组中定位基因将容易得多。
为了对河豚基因组进行测序,研究人员采用了所谓的全基因组鸟枪法策略。“我们首先将基因组切成足够小的片段进行测序,”位于加利福尼亚州核桃溪联合基因组研究所的团队成员丹·罗克萨尔 (Dan Rokhsar) 解释说。“当时的挑战是将近四百万个重叠的片段重新组装在一起——就像拼一个巨大的拼图一样。” 科学家们使用一种复杂的计算算法迎接了这一挑战。
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新加坡分子与细胞生物学研究所的陈谭 (Chris Tan) 指出,河豚基因组的测序将使人类基因库的估计更加准确。他补充说,“我们现在也能够改进许多非编码区域的特征,这些特征可能被证明对人类基因组中表达的基因具有调控控制作用。”