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所有不得不清理自家爱犬粪便的狗主人都知道，不仅仅是人类会经历胃肠道疾病。许多动物，包括人类最好的朋友，也会遭受短暂和慢性的消化问题。因此，一些兽医已经开始开出含有有益菌或“益生菌”的补充剂，以缓解腹泻、呕吐、胀气和腹胀等相关症状。但一些动物专家表示，几乎没有确凿的证据表明这些补充剂有效。
根据佛罗里达大学兽医学院小动物内科医生和临床营养学家Richard Hill的说法，胃肠道 (GI) 问题是犬类第二常见的健康问题，仅次于皮肤病。他指出，常见原因包括钩虫、鞭虫和贾第鞭毛虫等寄生虫，以及“饮食不当”，这可能意味着从狼吞虎咽地吃餐桌残羹剩饭到喝马桶里的水，再到翻垃圾。
田纳西大学兽医学院营养学家Susan Wynn表示，犬类也可能患有慢性腹泻，其根源在于细菌失衡或感染，如沙门氏菌、弯曲杆菌或大肠杆菌。
为了解决急性和慢性胃肠道疾病，一些兽医现在转向补充益生菌，即肠道内“有益细菌”，它们可能有助于消化，并帮助动物和人类抵御胃肠道疾病。Wynn说，有证据表明益生菌有助于预防鸡、猪和其他农场动物的感染，但没有“确凿的临床证据”表明它们对狗也有效。但她指出，初步研究表明，它们也可能对幼犬有益。
据爱尔兰科克大学学院Alimentary Pharmabiotic Center的免疫学家Liam O'Mahony称，总部位于辛辛那提的宝洁公司生产一种名为Prostora Max的软嚼益生菌补充剂，其中含有一种特殊的动物双歧杆菌菌株，该菌株在实验室研究中可以杀死引起疾病的细菌沙门氏菌和艰难梭菌。O'Mahony领导了发现和分离该菌株的团队，他说一项尚未发表的临床研究结果表明，该细菌有助于清除各种犬种的腹泻。
最近的研究包括31只患有腹泻的狗——10只德国牧羊犬、11只拉布拉多寻回犬、2只金毛寻回犬和8只拉布拉多-金毛寻回犬混血犬。接受益生菌的13只狗的恢复速度比其他动物快约40%——4天而不是7天。原因是什么？Mahoney推测，有益细菌会胜过那些导致胃肠道不适的细菌，或者益生菌可能会以某种方式增强肠道屏障。
与此同时，普瑞纳开发了一种名为Fortiflora的产品，其中含有屎肠球菌，该公司声称该产品可以增强狗狗的免疫反应。一些研究表明，服用屎肠球菌会导致血液中某些抗体（对抗病原体的蛋白质）浓度升高。
Hill说：“越来越多的证据表明益生菌确实能发挥作用。” 但在目前这个阶段，“问题和答案一样多。”