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使细菌产生耐药性的 DNA 可能越来越多地污染水源，从河流一直到水龙头。科学家警告说，如果不清除这些污染物，可能会加剧潜在有害微生物日益增长的耐药性问题。这些基因加入了一长串在水中发现的污染物名单，对设计有效的处理方法提出了挑战。
目前，世界卫生组织报告称，在美国每年有超过 200 万人感染耐药菌，其中 14,000 人因此死亡。细菌耐药性的上升与人类和动物中药物的广泛使用有关。高达 95% 的抗生素以未改变的形式排出体外，渗入环境，并可能在那里促进抗生素耐药性。