2014年，美国人填写了超过 1.7 亿张质子泵抑制剂 (PPI) 类抑酸剂处方，用于治疗胃部疾病，包括消化不良、消化性溃疡和胃酸反流。这些药物是美国处方量排名前 10 的药物之一，并且也可以在非处方药店购买。调查表明，这些药物被广泛滥用，在这种情况下，药物可能弊大于利。事实上，两项新的研究发现，PPI 会以可能增加危险肠道感染风险的方式改变肠道细菌，这进一步证明了该药物的不良影响。
为了弄清楚为什么服用 PPI 的人更容易感染肠道，格罗宁根大学和马斯特里赫特大学医学中心的荷兰研究人员，以及哈佛大学博德研究所和麻省理工学院的研究人员，对 1,815 人的粪便样本中的细菌 DNA 进行了测序。这样做使他们得以了解受试者肠道内的细菌情况。对服用 PPI 的受试者和未服用 PPI 的受试者的概况进行比较后发现，除其他事项外，PPI 使用者的肠道细菌多样性较低。
研究人员在《Gut》杂志上发表了他们的研究结果，他们发现即使 PPI 使用者没有胃肠道疾病，这些差异仍然存在，这表明这些差异是由药物引起的，而不仅仅是疾病的假象。（PPI 也被开给医院 ICU 患者，以预防应激性溃疡等。）
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伦敦国王学院、康奈尔大学和哥伦比亚大学的研究人员从一项设计相似的研究以及一项小型干预研究中获得了类似的结果，在该研究中，患者在服用 PPI 四到八周之前和之后分析了他们的肠道细菌。
PPI 可能会通过降低肠道酸度来限制肠道的多样性，从而创造一个或多或少适合某些微生物的环境。格罗宁根大学的胃肠病学家林斯·韦尔斯马说，这种失衡可能会导致感染。他解释说，这些药物可能会诱导“微生物组发生变化，从而创造出一个沙门氏菌或艰难梭菌可以生长的生态位”。
由于一个人的微生物组也会影响肠道对钙和其他维生素和矿物质的吸收，因此这些药物引起的改变可以解释为什么服用 PPI 的人更容易发生某些骨折和营养缺乏症。尽管目前尚无人知晓长期 PPI 使用者应该有多担心，但有一点是肯定的：“服用这些药物的医生和患者之间应该进行持续的对话和管理，”密歇根大学研究 PPI 过度使用的家庭医生乔尔·海德尔堡说。“有成千上万的患者长期服用这些药物，但实际上并不需要。”