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印度尼西亚的保护计划看起来计划周全，但随后发生了政治动荡。现在科学家预测，印度尼西亚的低地森林可能很快就会完全消失。二十年前，印度尼西亚政府认真审视了该国的森林，森林占其陆地面积的 70% 以上。他们根据可持续森林管理原则，将不同区域划定为保护区、集水区保护区和生产区。但根据《科学》杂志上新发表的一篇评论文章，这些理想与今天的现实相去甚远。“如果当前的资源无政府状态持续下去，”一个国际科学家团队写道，“巽他陆架的低地森林，地球上最丰富的森林，将在 2005 年在苏门答腊岛和 2010 年在加里曼丹岛被彻底摧毁。”
研究人员——牛津大学的保罗·杰普森、常驻印度尼西亚的詹姆斯·K·贾维、世界银行的凯西·麦金农和印度尼西亚莱user管理部门的凯瑟琳·A·蒙克——引用了几个案例研究，以及印度尼西亚自然保护局的一份报告，并得出结论，由伐木团伙进行的大规模非法伐木活动，通常与当地社区勾结，是罪魁祸首。他们还发现，不具备进行可持续森林管理能力的地区政府，无法执行国家政府最初设定的目标。除此之外，当地警察没有能力打击非法伐木，自然保护局的报告表明，可能有必要动用军队来保护国家公园。
低地森林是几种大型哺乳动物的家园，如苏门答腊犀牛、苏门答腊虎和亚洲象。森林破坏可能会威胁到它们的生存。作者指出，需要立即采取行动，但也承认这个问题没有简单的解决方案。“从以公司为基础的大规模开发转向低影响的合资企业，将需要彻底反思森林的盈利能力和受益者，”他们写道。