2018年，世界卫生组织提出了针对疟疾控制和消除的“10+1”倡议，目标是10个非洲国家和印度，这些国家共占全球病例的70%。尽管这种方法前景广阔，但它缺少一个重要的组成部分：基因组监测。耐药性威胁着迄今为止在抗击疟疾方面取得的所有进展，但基因组监测可以在诊所出现首个警告信号前几年检测到耐药性。它可以回答关于耐药性如何出现和传播的关键问题，并可以帮助控制干预措施的平衡，延长现有药物的有效寿命，并确保有效的治疗。
我呼吁世卫组织、全球卫生合作伙伴和疟疾界将强制性基因组监测纳入其中，使其成为疟疾负担最重国家的主要干预措施。这种基因组信息可以帮助疟疾控制项目使用高质量的数据集定期监测耐药性，为疟疾政策提供循证决策，并协助管理耐药性的传播。
受疟疾影响最严重的国家都有一种最终产生耐药性的首选药物。在非洲国家，20世纪末，氯喹是首选药物，但疟原虫对其产生了耐药性。然后在2000年代初期，这种药物被嘧啶乙胺和磺胺多辛的组合所取代，耐药性再次出现。现在，寄生虫正对当前的青蒿素联合疗法（ACTs）产生耐药性。青蒿素耐药性由位于13号染色体螺旋桨区域的kelchl3基因赋予。
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尽管这种基因的突变已在东南亚发生并在该地区蔓延，但人们担心它也会像之前的药物一样蔓延到非洲。我们使用越多药物来治疗疟原虫，由于选择压力，它们就变得越耐药，这为耐药性创造了先决条件。因为我们知道寄生虫的这种生物反应是不可避免的，所以我们应该采取措施来追踪这些变化何时出现：这样做将有助于我们预防疾病的传播，调查耐药性的出现，并随后保持当前一线抗疟治疗的有效性。
随着基因组技术的进步，科学家们已经能够分析来自携带疟原虫的患者和传播疟原虫的蚊子的疟原虫。这种分析已成为药物和杀虫剂耐药性的相关信息来源。研究表明，基因组监测帮助我们理解了不同蚊子物种如何产生并将疟疾传播给人类，这反过来又导致了更好地针对干预措施，因为媒介容量得到了更好的理解。
这种监测使人们对不断变化的传播强度和寄生虫基因流动（包括耐药基因）有了更深入的了解，并有助于量化从疟疾负担沉重的国家输入疟疾的风险。但是，将基因组监测作为一种工具的工作主要发生在研究领域，只有少数例子将其应用于疟疾负担仍然很高的实地。
基因组监测已在已经消除疟疾的国家中用于防止其复发，并在处于疟疾消除阶段的国家中使用。对于疟疾负担最重的非洲国家，情况也不应有所不同。从小儿麻痹症中吸取的教训表明，基因组监测在控制感染方面发挥了巨大作用。公共卫生官员已经能够使用高质量的数据来了解这种病毒的来源，绘制传播网络，并确定疫苗接种工作的方向。
现在是基因组监测从主要学术研究转向疟疾死亡发生的实地的时候了。我建议世卫组织应在其根除计划中纳入一个新的“工具包”，其中包括疟疾基因组学。这样的工具包将提供有价值的信息，这将使国家防治疾病的计划，特别是在10+1倡议中包括的非洲国家，更加有效。与任何公共卫生危机一样，我们知道的越多，就越好。