旗舰脑计划发布神经计算工具

人类脑计划项目呼吁更广泛的神经科学界开始使用其硬件和软件

Getty Images/iStockphoto

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欧洲主要的脑研究项目公布了一套原型计算工具,并呼吁全球神经科学界开始使用它们。此举标志着人类脑计划项目(HBP)为期30个月的启动阶段结束,并进入运营阶段。

计算平台的发布——包括脑模拟工具、可视化软件和一对可远程访问的超级计算机,用于实时研究大脑过程——可能有助于缓解人们对这项耗资10亿欧元(11亿美元)的项目对更广泛科学界益处的担忧。 

德国于利希研究中心的神经科学家、项目董事会成员卡特琳·阿蒙茨在3月30日的新闻发布会上说:“新平台为分析人脑开辟了无数新的可能性。”“我们很自豪能为全球脑科学界提供参与的机会。”


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但尚不清楚这些平台——其中一些可以免费访问,另一些只有在同行评审的申请成功后才能使用——将在项目之外的脑研究人员中引起怎样的反响。“在这一点上,没有人能说这些研究平台是否会成功,”德国慕尼黑路德维希-马克西米利安大学计算神经科学主席安德烈亚斯·赫茨说。

脑模拟

HBP的总体任务是收集和整合不同类型的神经科学数据,以在不同尺度上对人脑进行计算重建,从脑细胞内部到整个功能性大脑,并对其进行模拟。

自该项目于2013年启动以来,来自24个国家的800名科学家参与了开发工具,以促进普通神经科学界的合作研究。这些工具分为六个领域:神经信息学、脑模拟、医学信息学、高性能分析和计算、神经机器人学以及受脑启发的“神经形态”计算。

但该项目引起了 巨大争议。更广泛的神经科学界的许多人抱怨说,管理层夸大了该项目的计算平台能够实现的目标。2014年,约有150人 签署了一份请愿书,声称该项目管理不善,偏离了科学轨道,并承诺抵制HBP,除非他们的问题得到解决。(该请愿书此后已累积超过800个签名)。

一项于 2015年3月完成的独立审查 证实了这些担忧,并建议进行管理层变更。审查强调,HBP创建的计算基础设施必须对更广泛的科学界有用。为该项目提供大部分资金的欧盟委员会采纳了这些建议。

数据梦想

赫茨说,神经科学工具的发布表明,HBP的领导层承认该项目需要专注于提供具体的服务,让更广泛的神经科学界能够从中受益。但他警告说,该项目仍然依赖于“逻辑缺陷”,例如“梦想”通过来自神经元的稀疏记录可以生成密集数据。

HBP的神经形态计算平台联合负责人卡尔海因茨·迈尔说,科学家们还需要一些时间来学习如何使用这些工具。该平台位于英国曼彻斯特和德国海德堡。“我相信届时将开始涌现许多有用的应用,”他说。

HBP项目协调负责人、瑞士洛桑联邦理工学院的菲利普·吉耶以及项目董事会成员在新闻发布会上表示,这些平台的开发旨在最终成为一个永久性的泛欧研究基础设施。这种基础设施的一个例子是欧洲生物样本库和生物分子资源研究基础设施,这是一个分布式中心网络,研究人员可以通过该网络访问生物样本和相应的数据。然而,要使HBP达到这个阶段,需要各国政府承诺永久资助该项目。

本文经许可转载,最初于2016年3月31日首次发表

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