历史通常不被认为是科学，但如果它使用比较方法，就可以成为科学。 加州大学洛杉矶分校地理学教授贾雷德·戴蒙德和哈佛大学政府学教授詹姆斯·A·罗宾逊在新书《历史的自然实验》（哈佛大学出版社，2010年）中有效地运用了这种方法。例如，在一项及时研究中，戴蒙德将海地与多米尼加共和国进行了比较，结果表明，尽管两国都位于同一个岛屿伊斯帕尼奥拉岛上，但由于地缘政治差异，一个最终变得赤贫，而另一个则蓬勃发展。
克里斯托弗·哥伦布的兄弟巴托洛梅奥于1496年为西班牙殖民了伊斯帕尼奥拉岛，并在岛屿东侧的圣多明各建立了首都。两个世纪后，在法国和西班牙之间的紧张关系中，1697年的《里斯维克条约》将该岛西部一半的统治权授予法国。由于当时的法国比西班牙更富有，奴隶制是其经济不可或缺的一部分，因此法国将伊斯帕尼奥拉岛西部变成了奴隶贸易中心，人口差异惊人：该岛西部约有50万奴隶，而东部只有1.5万至3万奴隶。
人口压力的这种差异，加上法国渴望从海地进口更多木材，放大了地理因素的影响。伊斯帕尼奥拉岛的天气锋面来自东方，并在该岛的多米尼加一侧降雨，使海地一侧自然更干燥，农业生产力所需的肥沃土壤也更少。海地对农田和木材的需求迅速砍伐了岛屿一侧本已稀疏的树木，造成了灾难性的后果：土壤侵蚀、建筑木材和木炭燃料的损失、河流中更重的泥沙负荷以及减少水力发电潜力的流域保护减少。海地环境退化的这种负反馈循环使其陷入了肮脏的境地。
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当海地人和多米尼加人在19世纪都获得独立时，我们看到了其他比较差异。海地奴隶起义是暴力的，拿破仑为恢复秩序而进行的严厉干预导致海地人不信任欧洲人，并避开未来的贸易和投资、进出口、移民和迁出。海地奴隶还发展了他们自己的克里奥尔语，世界上没有人说这种语言，这进一步孤立了海地与文化和经济交流。总的来说，这些障碍意味着海地没有从通常积累资本、财富和富裕的因素中受益，而这些因素本可能在独立后带来繁荣。相比之下，多米尼加的独立相对是非暴力的；该国在独立和西班牙控制之间来回穿梭了几十年，西班牙在1865年决定不再想要这片领土。在整个这段时期，多米尼加人说西班牙语，发展出口，与欧洲国家进行贸易，并吸引了欧洲投资者，以及德国人、意大利人、黎巴嫩人和奥地利人等多元移民人口，他们帮助建立了充满活力的经济。
最后，即使当两国在20世纪中期都屈服于邪恶独裁者的权力时，拉斐尔·特鲁希略对多米尼加共和国的控制也带来了相当大的经济增长，因为他渴望个人致富，但他的政策导致了强大的出口产业，并进口了科学家和林务员来帮助保护森林，以供他从木材中牟取暴利。与此同时，海地独裁者弗朗索瓦·“爸爸医生”·杜瓦利埃没有做任何这些事情，反而进一步孤立了海地人与世界其他地方的联系。
戴蒙德承认，这个岛屿的漫长历史中涉及许多其他因素，但他写道，比较方法包括比较——最好是定量地，并在统计分析的帮助下——在许多方面相似但在人们希望研究其影响的因素方面不同的不同系统。
所有科学的核心是隔离少数几个强大的因素，这些因素解释了所测量事物的大部分差异。将比较方法与这种历史的自然实验结合使用，与社会学家和经济学家在比较当今社会的自然实验时所做的事情没有什么不同。因此，现在是科学家尊重历史作为一门科学，历史学家通过比较方法和其他技术检验其历史假设的时候了。
所有科学的核心是隔离少数几个强大的因素，这些因素解释了所测量事物的大部分差异。将比较方法与这种历史的自然实验结合使用，与社会学家和经济学家在比较当今社会的自然实验时所做的事情没有什么不同。因此，现在是科学家尊重历史作为一门科学，历史学家通过比较方法和其他技术检验其历史假设的时候了。