DNA 测序提速

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人类基因组的测序始于 1990 年,这是一项艰巨的任务,耗时约 13 年才完成。大规模 DNA 测序项目现在更为常见,因此科学家们正在研究新的方法以节省时间和金钱。《自然》杂志在线发表的一份报告描述了一种方法,该方法比传统方法快 100 倍。

这种新颖的测序技术由康涅狄格州布兰福德市 454 Life Sciences Corp. 的 Jonathan M. Rothberg 及其同事设计,使用微小的光纤反应容器,其深度仅为 55 微米,宽度为 50 微米——包含 160 万个孔的载玻片仅占用 60 平方毫米。该装置允许同时扩增和测序数十万个 DNA 分子。对该装置的测试使用光来测量反应,结果表明它可以在 4 小时的单次运行中测序 2500 万个碱基,准确率超过 99%。

为了将这种方法与标准程序进行比较,研究团队的一名成员成功地在新机器上的一次运行中测序并组装了寄生细菌生殖支原体的整个基因组,其中包括 580,069 个碱基对。结果覆盖了 96% 的基因组,准确率为 99.96%。作者得出结论,光纤的持续小型化表明,未来,当给定区域可以容纳更多测序孔时,这项技术可能会变得更快。

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