博客作者将化学反应置于可重复性检验之下

一个在线项目寻求众包帮助,以重现化学家已发表的成果

来自《自然》杂志

一群化学博客作者在业余时间四处搜寻化学品和设备,试图复制已发表的分子制备方案。研究人员希望检验科学家在论文中报告的“配方”是否容易重复,并邀请其他化学家加入他们。

“我们只是一群想让反应成功的人,”博主See Arr Oh解释道,他常驻美国,但不愿透露真名。其他团队成员包括来自新泽西州普林斯顿的化学研究生马特·卡彻,以及两位名为Organometallica和BRSM的博主,他们共同推出了Blog Syn,并在其中在线报告他们的进展。 


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See Arr Oh表示,他和其​​他人对化学文献感到沮丧的原因之一是,有些声称反应产生的产物量似乎超过了合理范围,并且关于进行反应的具体条件的细节也很少。在某些情况下,报告的反应似乎好得令人难以置信——例如,一篇2009年的论文在网络技术娴熟的化学家对实验进行直播博客后在24小时内被更正;这一事件部分启发了Blog Syn。“我永远不会忘记那个反应,”See Arr Oh补充道。 

英国考文垂华威大学的化学家彼得·斯科特说:“问问任何合成化学家,他们把大部分时间花在做什么上,他们都会承认是在让文献中的反应起作用。” “这就是合成化学中显而易见却避而不谈的问题。”

Blog Syn是化学家可以检查合成技术的几个平台之一。例如,《有机合成》杂志只发表经过其编辑委员会成员检查和验证过的合成程序。斯科特参与了另一个项目,旨在汇编一个包含约5000个化学程序的数据库,名为SyntheticPages,它是ChemSpider的一部分,ChemSpider是一个在线化学结构数据库。并且《可视化实验杂志》(JoVE)——一个同行评审的在线期刊,发布实验视频——将于2月4日推出一个化学频道。这可能有助于解决一些化学家面临的一个难题:已发表的化学反应是以一种标准格式编写的,这种格式本应使事物易于理解,但实际上往往需要一些不成文的调整才能使实验成功。

See Arr Oh表示,Blog Syn与JoVE和SyntheticPages不同,因为后者的倡议涉及化学家改进和验证他们自己的化学反应。相比之下,Blog Syn打算使用众包,这意味着外部人员——首先是博主已经认识的化学家——将检查其他人已经发表的工作。

案例测试
到目前为止,博主们已经研究了一个反应,他们选择这个反应是因为如果它易于复制,将会特别有用;它使用铁和硫催化剂来制造含有氧和氮的环状分子。按照已发表的方法,该团队无法获得像原作者那样多的最终产物。“它确实有效,但我们还不确定作者拥有哪些我们没有的因素,”See Arr Oh说。该团队的博文称,一个问题是,书面论文没有明确说明他们需要多么严格地将空气从反应中排除。

化学家们的在线努力反映了整个科学界越来越关注能够重现已发表程序的重要性。一个项目,可重复性倡议,去年成立,旨在使研究人员能够让外部检查员“验证”他们的研究。另一个项目,可重复性项目,致力于评估心理学实验的可重复性。该项目的主任,弗吉尼亚大学夏洛茨维尔分校的社会心理学家布赖恩·诺塞克认为,只有当化学家因参与而获得奖励时,Blog Syn才能发挥作用。

See Arr Oh承认,为Blog Syn提供资金将是在更大规模上发展它的挑战。他正在探索使博客更易于管理的方法,包括众包资助方法,如Kickstarter网站。在此之前,他将继续在业余时间检查反应。“目前,这些反应是在夜间秘密进行的,”他说。

本文经《自然》杂志许可转载。这篇文章于2013年1月21日首次发表

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