作者:比尔·伯克罗特
美国国家癌症研究所周一表示,一个新的统一系统启动,旨在促进癌症研究人员之间基因组和临床数据的共享,以帮助推进针对多种疾病形式的个性化治疗。
这个名为基因组数据共享(GDC)的项目细节,将由美国副总统乔·拜登在芝加哥举行的美国临床肿瘤学会会议上宣布。
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美国国家癌症研究所表示,GDC的运营中心位于芝加哥大学,将成为奥巴马总统的“国家癌症登月计划”和精准医学计划的关键组成部分,旨在寻找治疗方法。
该项目将从精准医学计划下分配给美国国家癌症研究所用于癌症基因组项目的7000万美元资金中获得资金,该计划包括利用先进的遗传信息将个体患者与最有可能帮助他们特定类型癌症的治疗方法相匹配。
越来越多的药物正在被开发出来,以解决与各种癌症和肿瘤类型相关的特定基因突变。
GDC将集中、标准化并使来自美国国家癌症研究所大型项目的数据可访问,例如癌症基因组图谱和针对儿童癌症的等效数据库,这些数据库被认为是世界上最大的癌症基因组数据集之一。这些信息将免费提供给任何癌症研究人员。
美国国家癌症研究所的 Louis Staudt 博士在一份声明中表示:“GDC还将保存来自一些较新的美国国家癌症研究所项目的数据,这些项目将对参与美国国家癌症研究所临床试验的患者的 DNA 进行测序。”
乔治敦大学数据科学家 Subha Madhavan 没有参与 GDC,她对该项目表示欢迎,考虑到所涉及的信息的复杂性和庞大数量。
Madhavan 在一份声明中说:“针对一位患者的个性化治疗的讽刺之处在于,我们必须管理来自数千其他患者的数十亿比特信息。”
她补充说:“根据患者的分子图谱选择精确的癌症治疗方法,需要对大量的分子、临床、患者病史和药理学数据集进行计算机辅助分析,这些数据通常来自非常分散和异质的数据源。”
美国国家癌症研究所表示,GDC 中代表数千名癌症患者和肿瘤的数据将使用标准化软件算法进行协调,以便研究人员可以访问并广泛使用它们。