今天，随着总部位于加利福尼亚州卡尔斯巴德的Life Technologies公司宣布，它将在今年推出一种新型测序仪，该测序仪最终将能够在一日之内以低于1000美元的价格解码整个人类基因组，从而使1000美元基因组的竞赛升温。这款名为Ion Proton的机器，将是该公司旗下子公司Ion Torrent生产的个人基因组测序仪的升级版。
为了不甘示弱，目前市场领导者、总部位于加利福尼亚州圣地亚哥的Illumina公司表示，它将在今年下半年发布自己的一天内完成基因组测序的竞争者，HiSeq 2500。 与要求客户购买全新机器的Life Technologies不同，Illumina表示，它将能够以相对较低的价格升级现有客户的HiSeq 2000机器。
那么，这场测序仪之战将如何发展呢？
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Ion Torrent将其新机器定位为Illumina售价69万美元的HiSeq的低成本替代品。科学家们似乎愿意相信Ion Proton将实现其速度目标，这主要是因为Ion Torrent目前的型号，即个人基因组测序仪，在客户中的表现良好。这使得Ion Torrent与其他无法在其第一代模型上交付成果的新技术公司区分开来，例如加利福尼亚州门洛帕克的Pacific Biosciences公司，该公司上周更换了首席执行官，并且陷入了财务和法律问题，以及总部位于马萨诸塞州剑桥的Helicos公司，该公司继续在需求不振的情况下苦苦挣扎。
SeqAnswers.com论坛上的这篇文章计算得出，2012年中期与Ion Proton一起发布的第一款测序芯片Proton 1将能够对三到六个人类外显子组进行测序，外显子组是基因组的基因编码部分。Life Technologies表示，今年年底与该机器一起发布的第二款测序芯片Proton II将包含足够的传感器来测序整个基因组。Life Technologies正在将Ion Proton定位为进入临床诊断测序市场，并计划今年向美国食品和药物管理局申请批准将该机器用作医疗设备。到目前为止，Illumina已经占据了大部分小而增长的临床测序市场。
但是科学家们不太相信使用Ion Proton测序人类基因组的成本将低于1000美元，或者运行成本会低于HiSeq。研究人员指出，目前，使用个人基因组测序仪测序人类基因组将花费数万美元。Life Technologies告诉我，Ion Proton的1000美元人类基因组估算包括运行的测序芯片和试剂的成本，但是高盛分析师Isaac Ro在一份研究报告中指出，Proton II芯片本身将花费1000美元，因此尚不清楚Life Technologies是如何得出1000美元这个数字的。
Ion Proton机器的成本相对较低，为149000美元，因此即使客户根据Ro的说法，还必须额外支付95000美元用于服务器和自动化样品制备设备，但他指出“价格点显然是同类产品中最好的，而且优势明显”。
但是Illumina提供以相当低的50000美元的价格将其现有客户升级到HiSeq 2500，因此他们可能没有太大的动力投资新的Ion Proton机器，特别是考虑到他们已经知道Illumina的技术非常准确，并且测序业务已经受到当前财政紧缩环境的影响。Life Technologies在发布个人基因组测序仪仅仅一年后就宣布推出新设备，似乎也惹恼了一些现有客户：“如此早地宣布一个PGM杀手真的是明智之举吗？” 尼克·洛曼在病原体：基因和基因组博客中问道。
尽管如此，在Ion Torrent平台中，Life Technologies终于找到了一种可以与Illumina竞争的方式，这是迄今为止其他任何公司都无法做到的，而且这种竞争只能对客户有利。随着大量其他测序技术处于不同的开发阶段，这些公告预示着新测序技术激动人心的一年即将开始。
此博客文章经《自然》杂志许可转载。该文章于2012年1月10日首次发表。